北京医药研究院注册的详细步骤包括：

1.核名。向工商局提交3-5个预设公司名称，以防止重名。

2. 提交材料。提交所需材料，包括注册资金及资金比例分配、股东信息、经营范围、注册地址、相关科研成果可行性报告等。

3. 通过互联网提交材料和电话约号。通过在线平台提交材料，并电话预约提交材料的时间。

4. 现场提交材料。根据预约时间，到工商局现场提交材料。

5. 领取营业执照和刻章。提交的材料被审核通过后，可以领取营业执照和刻章。

6. 国地税报道。根据规定，在领取营业执照后需要进行国地税报道。