一、研究院分类：

工商注册研究院：
（1）研究院有限公司，这种和普通公司一样，只不过所属行业属于研究院，一样需要法人、股东、监事、财务等，与公司享有同等纳税盈利权利；
（2）研究院个人独资企业，这种的是由一个投资人组成的，结尾是研究院，也是和公司组成是一样的；
（3）研究院股份合作制，这种是由企业员工共同设立成立的，由多个股东组成，原则上不吸收其他股份，与公司形式基本一致；
（4）研究院（普通合伙）、研究院（有限合伙），这两种企业和普通公司一样的设立要求，只是所属行业不同；
在当地工商部门申请：
名称也是以研究院结尾，是盈利机构，便于企业的项目开展还有同行业企业的合作。

二、性质和目标有所不同：
1、工商注册公司
工商注册公司主要着眼于经济利益和商业运作。注册公司是一种明确法律地位和经济实体的行为，旨在为企业提供法律保护并规范商业活动。工商注册公司需要遵守国家工商行政管理部门的相关法律法规，并承担相应的税收和经营责任。注册公司可以经营多种商业活动，包括制造业、服务业和金融业等。
2、工商注册研究院企业
同样，工商注册的研究院企业不仅有民非研究院的性质，比如专注于科学研究和技术创新。给人的感觉是一种科研机构的形式，旨在推动科学进步和技术发展。研究院通常由一群专家和学者组成，致力于特定领域的研究工作，例如医药、信息技术或环境保护等。
但同时工商注册研究院企业又可以具有普通公司的可营利经营的性质。

三、经营方式、管理结构的差异。
1、在经营方式方面：
注册公司主要以盈利为目的，追求经济效益和市场竞争力。公司的经营活动包括产品生产、销售和服务等，通过与客户和合作伙伴的交流合作实现企业发展。
注册研究院虽然可以和正常公司一样从事盈利业务，创造经济效益，但更注重科学研究的成果和技术创新的推广，通过发表学术论文和专利申请来宣传和推广科研成果。
2、在管理结构方面：
注册公司通常设有董事会、总经理和各部门负责人等职位，有明确的权责分工和决策程序。
注册研究院的管理结构相对简单，通常由院长和研究小组组成。

，工商注册公司和注册研究院在目标、性质、经营方式、管理结构和法律责任等方面存在着明显的区别。注册公司还是注册研究院取决于经营者实际需求和目标。